O conceito de gestão integrada das infestantes surgiu recentemente, na comunidade científica, pela preocupação com os problemas de saúde pública e ambiental, associados a fenómenos de resistências das espécies infestantes aos herbicidas. Neste trabalho realizou-se o estudo do banco de sementes do solo numa parcela experimental de um pomar de citrinos, localizado em Tavira (Algarve) e sujeito a diversos sistemas de gestão da flora infestante, com o objectivo de contribuir para um melhor conhecimento da biodiversidade associada e a eleição da gestão mais adequada. O delineamento experimental totalmente casualizado consistia em quatro modalidades (enrelvamento semeado, enrelvamento pela vegetação residente, aplicação de herbicida na entrelinha e aplicação de herbicida na linha) com quatro repetições. Foram retiradas 128 amostras de solo por modalidade, numa malha de 5 m x 5m a uma profundidade de 0-10 cm. Avaliaram-se as emergências semanalmente, tendo-se efectuado a contagem e identificação das espécies. Para cada um dos métodos de gestão da flora infestante foram obtidos, os valores da abundância a partir das densidades relativas (rD), e os índices de importância relativa (rI) por espécie. Para cada uma das modalidades de gestão da flora foram determinados os valores de diversidade e equabilidade. Foram identificadas 66 espécies. A maior emergência obteve-se no enrelvamento natural. Na composição do banco de sementes a espécie com maior importância foi o Piptaterum milliaceum (Poaceae). Diferentes métodos de gestão da flora infestante conduzem a alterações na composição do banco de sementes do solo. A biodiversidade variou em função da modalidade de gestão da flora.